Regular Sequencing
- Normal Sequencing
- Difficult Sequencing
- Additional Services
Special Sequencing
- Microbial Identification
- Full Sequencing
- Viral genome sequencing
- Mitochondrial DNA sequencing
- Bisulfite sequencing
- Fragment Analysis
- Cell line authentication
- NGS Integration service
- Designed PCR Sequencing (DPS)
Universal Primer list
Vector-Binding Primer
Troubleshooting
Troubleshooting
Failed DNA sequencing reaction
원인
- Bad DNA quality
- Wrong primer
해결 방안
- Template DNA를 cleanup 후 사용
- Template DNA에 primer site가 있는지 확인
Noisy or weak DNA sequencing traces
원인
- 너무 높거나 낮은 DNA 농도
- Primer 농도가 너무 낮거나 degradation되었을 때
해결 방안
- Agarose gel 전기영동 및 spectrophotometer 농도 측정으로 적정 농도 template 사용
- 적정 농도의 primer 사용과 반복적인 동결 및 해동을 피할 것
Mixed signal in the trace
원인
- 동일한 primer site를 가진 둘 이상의 template가 섞여 있을 경우
- 하나의 template 내에 동일한 primer site가 두 군데 이상일 경우
해결 방안
- Aagarose gel에서 DNA templated의 단일 샘플 여부 확인
- Template 염기서열을 확인해 보거나 다른 primer로 sequencing
Sudden ending of DNA sequence signal
원인
- DNA template내에 매우 안정적인 secondary structure
- 긴 G 또는 C stretch
해결 방안
- 역방향 primer로 sequencing
- Difficult sequencing 서비스로 진행
Slippage sequencing
원인
- 반복서열 또는 homopolymeric sequence
- Insertion 또는 deletion sequence가 있는 대립유전자
해결 방안
- 역방향 primer로 sequencing
- 각 대립 유전자에 특이적인 primer로 각각 sequencing
Blurry trace chromatogram peaks
원인
- Capillary overload
- High sequencing run voltages
해결 방안
- 적정량 및 적정조건으로 rerunning
Sharp peaks in the trace signal
원인
- Capillary안에 작은 gas bubble
해결 방안
- Buffer를 강하게 흔들지 말고 필요시 degassing 한 후 rerunning
