코스모진텍
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  • PCR-related Services

PCR-related Services

  • 서비스 소개

서비스 소개

  • PCR optimization
  • Realtime PCR
  • SNP genotyping
  • STR genotyping

서비스 개요

    • PCR specificity는 primer 서열, annealing 온도, Magnesium 농도, polymerase 종류, 반응 첨가물 등 다양한 인자에 의해 영향을 받습니다. 당사에서는 mixed template (genomic DNA, cDNA, library 등)를 사용한 target sequencing 및 cloning 서비스 의뢰시 그에 필요한 PCR 최적화 서비스를 제공해 드립니다.

서비스 내용

    • - Primer3 based primer design : 1차 primer set의 PCR 실패시 2차 primer set 합성 무료 제공
    • - DNA polymerase for cloning : KOD or PFU polymerase
    • - DNA polymerase for sequencing : G-taq or SP-taq polymerase
    • - Annealing temp. setting: 6 points gradient PCR
    • * 본 서비스에서는 cloning 및 sequencing에 연계한 endpoint PCR optimization 만을 제공합니다. 그외 다른 목적의 PCR 최적화는 당사에서 제공되지 않습니다.
    • * 선행 단계에서 PCR 성공시 이후 단계는 임의로 생략될 수 있습니다.

서비스 개요

    • Realtime PCR은 fluorescent dye 기반의 DNA detection system으로서 수 copy정도의 극미량의 DNA까지 검출이 가능한 고감도 PCR 기법입니다. 기초생물학연구에서 진단의학, 보건환경, 식품공학, 법의학 및 약학분야에 이르기까지 생물학 전반에 광범위하게 사용되고 있고, 특히 분자진단 분야에서는 이미 의료용기기로 승인되어 감염병질환진단, 암진단, 유전질환진단 등에 널리 사용되고 있습니다. Realtime PCR은 현재까지 다양한 방식이 개발되어왔는데 크게 나누면 SYBR green, Evagreen 등과 같은 DNA binding 형광 dye를 사용하는 방법과 taqman probe, molecular beacon 등과 같이 형광이 표지된 probe를 사용하는 방식이 있습니다. 연구자분들은 민감도 및 정확도 그리고 비용 등을 고려하여 실험목적에 적합한 Realtime PCR 방법을 선택하실 수 있습니다. 코스모진텍에서는 최신 장비와 자사 개발 제품으로 신속 정확한 realtime PCR 서비스를 제공해드립니다.

서비스 내용

    • - Primer/probe design
    • - Sample 종류 : total RNA, genomic DNA, cDNA, cell, tissue, bacteria, virus 등
    • - DNA/RNA prep and cDNA synthesis
    • - Dye-based Realtime PCR : SYBR green, Evagreen
    • - Probe-based Realtime PCR : Taqman probe
    • - Easy-to-understand report

Realtime PCR Instruments

    • - QuantStudio™ 7 Flex Real-Time PCR System (Applied Biosystems®)
    • - 7500 Fast Real-Time PCR Systems (Applied Biosystems®)
    • - CFX96 Touch™ Real-Time PCR System (Bio-Rad)

서비스 활용

    • - Gene expression analysis
    • - MicroRNA analysis
    • - Copy number evaluation
    • - CNV (Copy Number Variation) analysis
    • - SNP analysis
    • - Mutation detection
    • - TaqMan array card (ThermoFisher scientific)
    • - Pathogen detection

Workflow

서비스 개요

    • Single nucleotide polymorphism (SNP)는 개체의 phenotype 다양성은 물론 질병예측에 필요한 정보를 제공하는 대표적인 유전변이중의 하나입니다. 코스모진텍은 SNP 분석이 가능한 다양한 플랫폼을 갖추고 있으며, 연구목적에 적합한 실험설계에서 분석결과까지 체계적인 서비스를 지원합니다.

서비스 내용

    • - Sequencing-based SNP genotyping
      : Primer design, PCR & direct sequencing
    • - Realtime PCR-based SNP genotyping
      : Taqman SNP genotyping primer/probe design or validated Taqman probe set (Applied biosystems)
    • - Easy-to-understand report

활용 분야

    • - Population Genetics
    • - Pharmacogenomics
    • - Diagnostic Genomics
    • - Functional Proteomics
    • - Forensic science

Workflow

서비스 개요

    • STR (Short Tandem Repeat) 은 genomic DNA 상의 2-13 nucleotide unit의 수회에서 수십회 반복서열 구조의 microsatellite로서, 해당 반복염기의 반복횟수가 개체 및 집단 간 변이를 보이는 특징으로 개체 및 집단을 식별하는 genotyping marker로 널리 활용되고 있습니다.
    • 분석의 기본원리는 fragment analysis와 동일하게 형광 dye가 표지된 primer를 사용한 PCR product를 capillary electrophoresis를 통하여 고해상도로 size를 분석하는 것으로, 현재 가장 활용도가 높은 분야는 개인식별을 위한 법의학적 분석법입니다. 코스모진텍에서는 Applied Biosystems사의 3130xl 및 3730xl DNA analyzer 장비를 사용하여 high troughput STR genotyping 서비스를 제공해 드립니다.

서비스 내용

    • - Commercial STR genotyping kit를 사용한 STR profiling
    • - STR multiplex PCR setup
    • - Capillary electrophoresis running (GeneScan analysis)
    • - GeneMapper software를 사용한 size 및 allele 분석
    • - Easy-to-understand report

활용 분야

    • - Human & domestic animals identification
    • - Cell line authentication
    • - 유전자원의 보존 및 관리
    • - 생태 및 유전적 다양성에 대한 연구

Workflow

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